Duration
3周每周学习
5个小时数字升级
Free生物学家的生物信息学：Linux，bash脚本和R的简介
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生物信息学是一个快速增长的学术领域，并且有望改变我们分析和比较生物学数据的方式。
On this course, you’ll get familiar with Linux – the operating system often used to access and analyse biological data. You’ll come away able to navigate it using the command line, understanding how to write scripts and prepare data files for further analysis and visualisation.
Much bioinformatics software is available for use through Linux, via the command line, which many biologists are unfamiliar with.
与国际生物信息学家团队一起，您将了解Linux的主要特征，以及它在生物学中的使用方式。您将能够描述Linux文件系统的结构化，并学习如何使用Linux命令来浏览文件系统。
您将使用Linux命令来操纵生物数据文件，并准备将其导出到其他环境中以进行进一步分析。该课程将向您介绍R语言和RSTUDIO软件环境的基础知识。
您还将学习编写和执行简单bash脚本以自动化数据处理的基础知识。
The Wellcome Genome Campus (WGC) is one of the globe’s leading bioinformatics centres, pioneering vital research into genome analysis.
On this course, the educators from WGC Advanced Courses and Scientific Conferences are joined by experts from the Institut Pasteur de Tunis, to give you practical training using real biological data in different biological scenarios. This will help you see how you can work with data in your own field of biology.
跳到0分8秒生物信息学对于生物学数据的分析，解释和可视化至关重要。Linux命令行，bash脚本和R是生物信息学家使用的最强大的工具之一。这个令人兴奋的，互动的课程为这三者提供了介绍。我们将演示如何使用一些简单的命令来分析和转换您自己的数据。然后，我们将浏览bash脚本的基本步骤，从命令行中的运行命令一一移动到编写将为您运行的脚本。一路上，您会发现狂欢脚本，几乎无限的处理大数据。您会开始发现它们是您日常分析的核心，就像我对我一样。
跳到0分钟48秒我们还将通过R使用R的易用性和功率来介绍分析和视觉代表您的数据的基础知识，现在将其扩展到许多领域。全球R用户的数量正在迅速增长。通过与我们一起学习R，您将开始执行和视觉代表自己数据的分析的道路。因此，加入我们，探索命令行，bash脚本和R可以释放生物信息学的全部力量的方式。
You can take this self-guided course and learn at your own pace. On every step of the course you can meet other learners, share your ideas and join in with active discussions in the comments.
在课程结束时，您将能够...
This course will appeal to students, biologists, and research scientists with an interest in bioinformatics.
期望学习者对生命科学有一定的了解或经验，但是没有预期的计算或生物信息学的先验知识。没有正式的先决条件。
Windows用户可能需要下载并安装UNIX仿真程序。Linux和Mac用户可以在终端会话中运行UNIX命令。该课程示例也可以使用基于浏览器的在线模拟器运行。
For the best learning experience, learners should have a computer available to them, not just a handheld device.
I am the IT Manager for the Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences team. My interests lie in bioinformatics and its application to microbial genomics.
突尼斯研究员的研究人员和生物信息学教练。对与病原体相关的基因组学和转录组学的数据分析和可视化充满热情
As a Prinicipal Bioinformatician in Experimental Cancer Genetics at the Wellcome Sanger Institute, I develop and run pipelines for saturation mutagenesis, CRISPR screens, RNA-Seq and variant calling.
I am the Assistant IT Manager for the Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences team. My interests include machine learning and coding.
惠康连接科学发展并提供了针对生物医学的开放研究生课程和会议。
Wellcome Connecting Science为加入本课程的每个人提供免费的数字升级，以便您可以免费获得在线学习的全部好处。这意味着您得到：
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