一个实用指南SARS-CoV-2全基因组测序

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学习基础的病毒测序,测序库制备和SARS-CoV-2测序最佳实践。

持续时间
3周
每周学习
5个小时
100%的在线
它是如何工作的
数字升级
免费的

一个实用指南SARS-CoV-2全基因组测序

2165年学习这门课程

概述

教学大纲

开始日期

需求

教育工作者

包括什么

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加强你的基因组学知识监测方法

准确的测序信息需要告知循证公共卫生决策应对COVID-19等传染病和流行病。本课程强调相关的所有必需的步骤处理,测序,分析病毒样本。

这三个星期的课程将提供工具和资源能力建设旨在加强基因组学监测方法。

调查SARS-CoV-2测序方法

使用的研究,文章和视频,你将访问信息和技术优化当前的数据处理和处理。

您将了解测序平台和库制备方法,比较每种方法的优缺点及其相关协议。

应用数据质量控制和分析

介绍数据质量控制指标和标准,您将学习如何解释高质量数据以及如何执行基本的病毒遗传多样性分析。

您将学习如何处理和报告的质量控制以及基因组测序的伦理性考量。

为全球应对COVID-19作出贡献

一旦配备的技能来收集和分析你的数据,你将能够讨论和计划为你的团队最合适的策略。

你将获得全球专家如何克服挑战的概述应对流感大流行以及如何可以将这些经验应用到其他全球卫生威胁。

你将完成这门课程的理解病毒测序的整个过程,能够做出重要贡献病原体基因组学的发展在全球背景下的能力。

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跳到0分15秒欢迎来到课程“SARS-CoV-2全基因组测序的实用指南”。在这三周课程中,您将学习的基本概念病毒测序,测序图书馆准备,以及如何应用SARS-CoV-2测序最佳实践。您将了解不同的测序平台和库制备方法。你会比较其优点和局限性。您还将了解样本和数据质量控制指标和标准。在一起,我们将调查高通量序列生成方法。并了解如何解释序列数据的输出管道。在本课程中,您还将了解如何确定扩大SARS-CoV-2测序的方法。

跳到0分59秒课程接近尾声时,您将了解序列分析,变量分类,和其他方面,如质量控制报告和伦理方面的考虑。整个课程是挤满了实用信息,文章,和视频来帮助你理解病毒测序的整个过程。这门课是一个系列的一部分课程开发的全球培训或COG-Train COVID-19基因组学。一项全球发展SARS-CoV-2基因组学能力。我们希望你喜欢这门课,与来自世界各地的同事讨论。

教学大纲

星期1

病毒测序原理
- 欢迎来到第一周
  
  在这里我们将向您介绍本课程的教育工作者和贡献者,并提供有用的信息。
- 介绍病毒基因组学和测序
  
  回顾SARS-CoV-2基因组测序技术的基本概念
- 测序方法对SARS-CoV-2
  
  了解主要SARS-CoV-2基因组序列测序平台使用
- 确保样品和数据质量
  
  发现如何为高质量的测序样品收集和存储数据
- 第一周结束
  
  本周复习你所学到的东西和评估你的进步
星期2

图书馆准备和测序
- 用于SARS-CoV-2全基因组测序的协议
  
  讨论最常用的协议的优缺点SARS-CoV-2测序
- 基础库准备和测序
  
  学习的细节主要方法用于图书馆准备和测序
- 为扩大实际考虑
  
  如何从测序一个样本测序成千上万的呢?从专家学习技巧
- 星期2月底
  
  检查你的学习进展如何
星期3

测序分析和解释
- 数据质量控制
  
  学习如何访问数据和评估其质量
- 基本分析SARS-CoV-2
  
  引入病毒遗传多样性分析
- 如何与世界分享你的数据
  
  同意的概述、公共卫生报告和如何建立国际合作
- 星期3月底
  
  检查你在这门课学到和发现什么是下一个